##尝试http：//如果不支持https：// url source（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“rtracklayer”）

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅rtracklayer.。

R接口到基因组浏览器及其注释轨道

生物导体版本：2.10

可扩展框架，用于与多个基因组浏览器（当前UCSC内置）和以各种格式操纵注释轨道（目前GFF，床，床GGRAGG，Bed15，Wig，Bigwig和2bit内置）。用户可以向/从受支持的浏览器导出/导入曲目，以及查询和修改浏览器状态，例如当前视口。

作者：迈克尔·劳伦斯，Vince Carey，Robert绅士

维护者：Michael Lawrence

安装

要安装此包，请启动R并输入：

##尝试http：//如果不支持https：// url source（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“rtracklayer”）

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“rtracklayer”）

PDF.		rtracklayer.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	注解那DataImport.那软件那可视化
版本	1.16.3.
在生物导体中以来	BIOC 2.2（R-2.7）（8年）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 2.10），方法，Genomicranges.
进口	XML.（> = 1.98-0），生物根系（> = 0.1.0），绞喉（> = 1.13.14），Genomicranges.（> = 1.7.28），生物仪器（> = 2.23.2），bsgenome.（> = 1.23.1），Zlibbioc.那rcurl.（> = 1.4-2），RSAMTOOLS.（> = 1.7.3）
链接到	绞喉
建议	人力系统那microRNA.（> = 1.1.1），Genefilter.那林马那org.hs.eg.db.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那hgu133plus2.db.
系统要求
加强
URL.
取决于我	eatonetalchipseq.那r3cseq.
进口我	ChromheatMap.那funcisnp.data.那Genelendatabase.那基因组法那GGBIO.那GVIZ.那lumi.那r453plus1toolbox.
建议我	Biovizbase.那基因组法那Genomicranges.那Genomicranges.那GGTUT.那Ind1kg.那图案那ringerpeaks.那onechannelgui.那图片那p那r453plus1toolbox.那林诺那rmat.那TSSI.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	rtracklayer_1.16.3.tar.gz.
Windows二进制文件	rtracklayer_1.16.3.zip.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.6（雪豹）
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocondion-mirror/rtracklayer/tree/release-2.10
包短网址	http://biocidodder.org/packages/rtracklayer/
包裹下载报告	下载统计信息