要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“QRQC”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

QRQC

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅QRQC

快速阅读质量控制

生物导体版本:2.10

快速扫描读取和收集基础和质量频率的统计,读取长度,k次k-mers按位置和频繁的序列。在质量控制管道中使用统计数据的图形输出,以及可选的HTML质量报告。S4序列ummary对象允许在收集的数据周围写入特定的测试和功能。

作者:vince buffalo

维护者:vince buffalo

引文(从R内,输入引文(“QRQC”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“QRQC”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“QRQC”)

PDF. 使用QRQC包收集有关序列质量的信息
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. DataImport.Highthrougputsequencing.预处理QualityControl.测序软件可视化
版本 1.10.0
在生物导体中以来 BIOC 2.8(R-2.13)(5年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 重塑ggplot2.生物仪器Biovizbase.酿造xtable.RSAMTOOLS.(> = 1.3.28),testthat.
进口 重塑ggplot2.生物仪器Biovizbase.,图形,方法,普利尔,统计数据
链接到 RSAMTOOLS.
建议
系统要求
加强
URL. http://github.com/vsbuffalo/qrqc.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 qrqc_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件 qrqc_1.10.0.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/qrqc/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/qrqc/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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