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文学

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅文学

处理和分析高通量系统发育序列数据。

生物导体版本:2.10

PhyloseQ是一组类,工具,以促进系统发育测序数据的导入,存储,分析和图形显示。

作者:Paul J. McMurdie ,Susan Holmes

维护者:Paul J. McMurdie

引文(从R内,输入引文(“Phyloseq”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Beoclite(“Phyloseq”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“Phyloseq”)

PDF. 使用植物的分析例子
PDF. 使用Phyloseq的基本数据操作
PDF. phyloseq_classes_4.pdf.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 分类聚类遗传性Highthrougputsequencing.多重组块QualityControl.软件
版本 1.0.3
在生物导体中以来 BIOC 2.10(R-2.15)(4年)
执照 AGPL-3
依靠 R(> = 2.15.0),方法,ADE4.(> = 1.4),(> = 2.8),ggplot2.(> = 0.9.2),野餐(> = 1.3),重塑(> = 0.8.4)
进口 Foreach.(> = 1.3),iGraph0(> = 0.5),Multtest.(> = 2.8),普利尔(> = 1.7),rjsonio.(> = 0.98),素食主义者(> = 2.0)
链接到
建议 Genefilter.
系统要求
加强 多达齐全(> = 1.0)
URL.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 phyloseq_1.0.3.tar.gz.
Windows二进制文件 phyloseq_1.0.3.zip.
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/physosq/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/physoseq//
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文件»

生物体

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支持»

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