要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“pcaMethods”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见pcaMethods.
Bioconductor版本:2.10
提供贝叶斯PCA,概率PCA, Nipals PCA,逆非线性PCA和传统的SVD PCA。基于聚类的缺失值估计方法用于比较。BPCA、PPCA和NipalsPCA可用于对不完整数据进行PCA,也可用于准确的缺失值估计。还提供了一套用于打印和绘制结果的方法。所有的PCA方法都使用相同的数据结构(pcaRes)来为PCA结果提供唯一的接口。由德国马普分子植物生理学研究所发起。目前由中国科学院- mpg计算生物学合作研究所(PICB)和日本理化研究所植物科学中心(横滨)共同开发。
作者:Wolfram Stacklies, Henning Redestig, Kevin Wright
维护者:Wolfram Stacklies < Wolfram。在gmail.com stacklies >
引文(从R中输入引用(“pcaMethods”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“pcaMethods”)
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“pcaMethods”)
数据与异常值 | ||
介绍 | ||
缺失值归责 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,软件 |
版本 | 1.42.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.9 (R-2.4)(9.5年) |
许可证 | GPL (> = 3) |
取决于 | Biobase,质量,请、方法、Rcpp(> = 0.8.7) |
进口 | BiocGenerics |
链接 | Rcpp |
建议 | aroma.light |
SystemRequirements | Rcpp |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | pcaMethods_1.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | pcaMethods_1.42.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/pcaMethods/tree/release-2.10 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pcaMethods/ |
包下载报告 | 下载数据 |