要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“NEM”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

NEM.

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅NEM.

嵌套效果模型重建表型层次结构

生物导体版本:2.10

包装'NEM'允许从扰动效果的嵌套结构重建途径的特征。它需要输入(1.)一组靶向靶向的途径组分,和(2.)这些扰动的高维表型读数(例如基因表达,蛋白质表达)。输出是表示表型层次结构的定向图。

作者:Holger Frohlich,Florian Markowetz,Achim Tresch,Theresa Niederberger,Christian Bender,Matthias Maneck,Claudio Lottaz,Tim Beissbarth

维护者:Holger Froehllich

引文(从R内,输入引文(“NEM”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“NEM”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“NEM”)

PDF. Markowetz-论文-2006.PDF
PDF. 嵌套效果模型 - 果蝇免疫反应中的一个例子
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 生物信息学graphsandnetworks.微阵列途径软件
版本 2.32.1
在生物导体中以来 BIOC 1.9(R-2.4)(9.5岁)
执照 GPL(> = 2)
依靠 r(> = 2.0),E1071.(> = 1.5),图形(> = 1.24),rghrachviz(> = 1.22),Plotrix.林马(> = 1.11),Statmod.HMISC.
进口 靴子E1071.图形,图形,grdevices,方法,RBGL.(> = 1.8.1),rcolorbrewer.rghrachviz,统计,utils
链接到
建议 BioBase.(> = 1.10)
系统要求
加强 domc.
URL. http://www.biocadiond.org.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 nem_2.32.1.tar.gz.
Windows二进制文件 nem_2.32.1.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/nem/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/nem/
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生物体

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