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此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅NEM.。
生物导体版本:2.10
包装'NEM'允许从扰动效果的嵌套结构重建途径的特征。它需要输入(1.)一组靶向靶向的途径组分,和(2.)这些扰动的高维表型读数(例如基因表达,蛋白质表达)。输出是表示表型层次结构的定向图。
作者:Holger Frohlich,Florian Markowetz,Achim Tresch,Theresa Niederberger,Christian Bender,Matthias Maneck,Claudio Lottaz,Tim Beissbarth
维护者:Holger Froehllich
引文(从R内,输入引文(“NEM”)
):
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BROWSEVIGNETTES(“NEM”)
PDF. | Markowetz-论文-2006.PDF | |
PDF. | 嵌套效果模型 - 果蝇免疫反应中的一个例子 | |
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | 生物信息学那graphsandnetworks.那微阵列那途径那软件 |
版本 | 2.32.1 |
在生物导体中以来 | BIOC 1.9(R-2.4)(9.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | r(> = 2.0),E1071.(> = 1.5),图形(> = 1.24),rghrachviz(> = 1.22),Plotrix.那林马那簇(> = 1.11),Statmod.那HMISC. |
进口 | 靴子那E1071.那图形,图形,grdevices,方法,RBGL.(> = 1.8.1),rcolorbrewer.那rghrachviz,统计,utils |
链接到 | |
建议 | BioBase.(> = 1.10) |
系统要求 | |
加强 | domc. |
URL. | http://www.biocadiond.org. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | nem_2.32.1.tar.gz. |
Windows二进制文件 | nem_2.32.1.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/nem/tree/release-2.10 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/nem/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |