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此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅弥撒。

处理illumina甲基化数据

生物导体版本：2.10

此包提供用于持有和操纵Illumina甲基化数据的类。基于ESET，它可以包含Miame信息，示例信息，特征信息和多个数据矩阵。“智能”导入功能，MethyLumir可以读取Illumina文本文件并创建甲基麦内容。甲基umidat可以直接从人甲基化27和人甲基化450微阵列读取原始IDAT文件。还包括归一化，背景校正，以及Goldengate，Infinium和Infinium HD阵列的质量控制特征。

作者：肖恩戴维斯，潘杜，索维比尔克，蒂姆特谢，Jr.，Moiz Bootwalla

维护者：Sean Davis

安装

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文件

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BROWSEVIGNETTES（“METHYLUMI”）

PDF.		甲基umi包装介绍
PDF.		参考手册
文本		自述

细节

Biocviews.	CPGISLAND那德甲基化那预处理那QualityControl.那软件那两种通道
版本	2.2.0
在生物导体中以来	BIOC 2.5（R-2.10）（6.5岁）
执照	GPL-2
依靠	BioBase.，方法，r（> = 2.13），秤那重塑2.那ggplot2.
进口	BioBase.，图形，格子那注释那Genefilter.那annotationdbi.，统计数据4，生物根系
链接到
建议	lumi.那格子那林马那xtable.那Illuminahumanmethylation27k.db.（> = 1.4.4），illuminahumanmethylation450k.db.那SQN.那大量的那MatrixStats.， 平行
系统要求
加强
URL.
取决于我	lumi.
进口我	FFPE.那lumi.
建议我	illuminahumanmethylation450k.db.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	methylumi_2.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件	methylumi_2.2.0.zip.
Mac OS x 10.6（雪豹）
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/methylumi/tree/release-2.10
包短网址	http://biocidodder.org/packages/methylumi//
包裹下载报告	下载统计信息