要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“limma”)

在大多数情况下,根本不需要下载包存档。

limma

这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见limma

微阵列数据的线性模型

Bioconductor版本:2.10

微阵列数据的数据分析、线性模型和差异表达。

作者:Gordon Smyth, Matthew Ritchie, Jeremy Silver, James Wettenhall, Natalie Thorne, Mette Langaas, Egil Ferkingstad, Marcus Davy, Francois Pepin, Dongseok Choi, Davis McCarthy, Di Wu, Alicia Oshlack, Carolyn de Graaf, Yifang Hu, Wei Shi and Belinda Phipson。

维护者:Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>

引文(从R中输入引用(“limma”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“limma”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“limma”)

PDF Limma装饰图案
PDF usersguide.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学,DataImport,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparisons,OneChannel,预处理,质量控制,软件,TimeCourse,TwoChannel
版本 3.12.3
Bioconductor自 BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 2.3.0),方法
进口
链接
建议 affy,质量,org.Hs.eg.db样条函数,statmod(> = 1.2.2),vsn
SystemRequirements
增强了
URL http://bioinf.wehi.edu.au/limma
取决于我 a4Base,AffyExpress,affylmGUI,Agi4x44PreProcess,AgiMicroRna,吸引,birta,CALIB,亚兰,cghMCR,ChIPpeakAnno,clippda,codelink,转换,Cormotif,coRNAi,刨边机,HTqPCR,inSilicoMerging,limmaGUI,LVSmiRNA,时间的,maigesPack,marray,MmPalateMiRNA,nem,qpcrNorm,林格,snapCGH,TurboNorm
进口我 affycoretools,ArrayExpress,arrayQuality,arrayQualityMetrics,ArrayTools,吸引,beadarray,BeadArrayUseCases,betr,CALIB,CancerMutationAnalysis,魅力,ChIPpeakAnno,DiffBind,explorase,GeneSelectMMD,GeneSelector,GGBase,HTqPCR,iChip,maSigPro,minfi,MmPalateMiRNA,奥林,PatientGeneSets,phenoTest,林格,RNAinteract,RNAither,RTopper,snapCGH,SSPA,timecourse,tweeDEseq,vsn
建议我 ABarray,beadarraySNP,BiocCaseStudies,生命网络,类别,categoryCompare,CMA,coGPS,dyebias,GeneSelector,GEOquery,GSRI,GSVA,Heatplus,莱斯,光民,methylumi,中长期规划,益生元,oneChannelGUI,PGSEA,plw,PREDA,彪马,RTopper,rtracklayer,股东价值分析,virtualArray
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 limma_3.12.3.tar.gz
Windows二进制 limma_3.12.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/limma/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/limma/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈金森癌症研究中心