安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“hopach”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

hopach

这个包是2.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅hopach

分层要求分区和混合(HOPACH)崩溃

Bioconductor版本:2.10

HOPACH聚类算法构建集群的层次树递归分区数据集,而排序和可能崩溃在每个水平集群。算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)标准确定树的水平,最大限度地均匀集群。它也运行树下生产最后一个元素的有序列表。非参数引导允许一个估计的概率每个元素属于每个集群(模糊聚类)。

作者:凯瑟琳·s·波拉德,范德朗Mark j . <拉恩说道:stat.berkeley.edu >和格雷格墙

维护人员:凯瑟琳·s·波拉德<凯瑟琳。波拉德:gladstone.ucsf.edu >

从内部引用(R,回车引用(“hopach”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“hopach”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“hopach”)

PDF bootplot.pdf
PDF dplot.pdf
PDF hopach
PDF hopachManuscript.pdf
PDF MSS.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类,软件
版本 2.16.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.11.0),集群,Biobase、方法
进口 Biobase,集群,图形,grDevices,方法,属性,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://www.stat.berkeley.edu/ ~拉恩说道/http://docpollard.org/
取决于我
进口我 phenoTest
建议我 BiocCaseStudies
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 hopach_2.16.0.tar.gz
Windows二进制 hopach_2.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/hopach/tree/release - 2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/hopach/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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