安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“hopach”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅hopach。
Bioconductor版本:2.10
HOPACH聚类算法构建集群的层次树递归分区数据集,而排序和可能崩溃在每个水平集群。算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)标准确定树的水平,最大限度地均匀集群。它也运行树下生产最后一个元素的有序列表。非参数引导允许一个估计的概率每个元素属于每个集群(模糊聚类)。
作者:凯瑟琳·s·波拉德,范德朗Mark j . <拉恩说道:stat.berkeley.edu >和格雷格墙
维护人员:凯瑟琳·s·波拉德<凯瑟琳。波拉德:gladstone.ucsf.edu >
从内部引用(R,回车引用(“hopach”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“hopach”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“hopach”)
bootplot.pdf | ||
dplot.pdf | ||
hopach | ||
hopachManuscript.pdf | ||
MSS.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | 聚类,软件 |
版本 | 2.16.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.11.0),集群,Biobase、方法 |
进口 | Biobase,集群,图形,grDevices,方法,属性,跑龙套 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.stat.berkeley.edu/ ~拉恩说道/http://docpollard.org/ |
取决于我 | |
进口我 | phenoTest |
建议我 | BiocCaseStudies |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | hopach_2.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | hopach_2.16.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/hopach/tree/release - 2.10 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/hopach/ |
包下载报告 | 下载数据 |