##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("genoset")

此包适用于Bioconductor的2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见genoset．

提供类似于ExpressionSet的类用于拷贝号分析

Bioconductor版本:2.10

加载、操作和绘制copynumber和BAF数据。GenoSet类通过为IRanges包中的RangedData对象添加一个“locData”插槽来扩展eSet。该对象包含特征基因组定位数据，并提供简单的基因组定位子集。CNSet和BAFSet扩展了基因集，需要复制数(cn)或对数- r比(lrr)和b -等位基因频率(baf)数据的assayData矩阵。实现并提供了拷贝数和b -等位基因频率数据处理的方便函数。

作者:Peter M. Haverty

维护者:Peter M. Haverty在gene.com>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("genoset")

文档

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browseVignettes(“genoset”)

PDF		genoset
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariants，DataRepresentation，基础设施，微阵列，单核苷酸多态性，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor公司	BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10)，方法，BiocGenerics(> = 0.1.6),Biobase(> = 2.15.1),IRanges(> = 1.13.5),bigmemory，GenomicRanges
进口	方法,BiocGenerics，Biobase，DNAcopy、图形、IRanges统计数据,GenomicRanges，Biostrings，BSgenome，bigmemory
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了	平行,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
URL
全靠我	VegaMC
进口我	光民
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	genoset_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	genoset_1.6.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/genoset/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genoset/
软件包下载报告	下载数据