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此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见gene2pathway．

基于InterPro结构域特征的单个基因KEGG通路成员度预测

Bioconductor版本:2.10

该软件包获取一个基因列表，并预测每个基因映射到哪个KEGG通路。这是通过观察每个基因的InterPro结构域来完成的。每个预测都被赋予一个置信度分数。该包还允许预测信号通路内基因的连接组件成员。可以训练由KEGG支持的每种生物的单独模型。

作者:Holger Froehlich

维护者:Holger Froehlich

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gene2pathway”)

文档

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browseVignettes(“gene2pathway”)

PDF		gene2pathway
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学，分类，GraphsAndNetworks，微阵列，通路，软件
版本	2.10.1
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.10.0)，kernlab(> = 0.9),biomaRt(> = 1.12.1),KEGGSOAP(> = 1.12.0),RBGL，AnnotationDbi，org.Dm.eg.db，keggorthology(> = 2.0)
进口	SSOAP,RCurl
链接
建议
SystemRequirements
增强了	doMC
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	gene2pathway_2.10.1.tar.gz
Windows二进制	gene2pathway_2.10.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/gene2pathway/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gene2pathway/
软件包下载报告	下载数据