要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gage”)
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计
  |
此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见计．
途径分析的一般适用基因集富集
Bioconductor版本:2.10
GAGE是一种已发表的基因集或通路分析方法。GAGE通常适用于独立于微阵列数据属性，包括样本量、实验设计、微阵列平台和其他类型的异质性，并且始终优于其他常用方法。在gage包中，我们提供了基本gage分析、结果处理和表示的功能。我们还建立了一批多个GAGE分析的管道例程，并行分析之间的比较，以及来自不同来源/研究的异质数据的组合分析。此外，我们还提供了基于KEGG通路和GO术语的演示微阵列数据和常用基因集数据。这些功能和数据对于使用其他方法进行基因集分析也很有用。
作者:罗维钧
维护者:Weijun Luo < Luo Weijun at yahoo.com>
引文(从R内，输入引用(“规”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gage”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“规”)
| 通用基因集/通路分析 | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 生物信息学，DataRepresentation，DifferentialExpression，去，遗传学，微阵列，MultipleComparisons，OneChannel，通路，RNAseq，软件，TwoChannel |
| 版本 | 2.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2.0) |
| 取决于 | R (>= 2.10)，图，乘 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | gageData，GO.db，GSEABase，KEGG.db，org.Hs.eg.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.biomedcentral.com/1471-2105/10/161 |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | gageData |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 包的来源 | gage_2.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gage_2.6.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/gage/tree/release-2.10 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/gage/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
