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此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见exomeCopy．

从外显子组测序深度检测CNV

Bioconductor版本:2.10

检测拷贝数变异(CNV)从外显子组测序样本，包括未配对的样本。该包实现了一个隐马尔可夫模型，该模型使用位置协变量，如背景读取深度和GC-content，同时将样本归一化并分割为常量拷贝计数的区域。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:Michael Love < Love at molgen.mpg.de>

安装

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文档

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browseVignettes(“exomeCopy”)

PDF		外显子组测序数据中的CNV检测
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariants，遗传学，HighThroughputSequencing，测序，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	IRanges，GenomicRanges，Rsamtools
进口	stats4、方法
链接
建议	Biostrings
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	exomeCopy_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	exomeCopy_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/exomeCopy/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/exomeCopy/
软件包下载报告	下载数据