要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见eisa.
Bioconductor版本:2.10
迭代签名算法(ISA)是一种双聚类算法;它在基因表达(或其他表格)数据中发现相关的块(转录模块)。ISA能够发现重叠的模块,并且对噪声有弹性。这个包提供了ISA的方便接口,使用标准的BioConductor数据结构;还包含各种可视化工具,可以与其他双聚类算法一起使用。
作者:Gabor Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >
维护者:Gabor Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >
引文(从R中输入引用(eisa)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (eisa)
ISA_internals.pdf | ||
eisa和biclust的包裹 | ||
基因表达数据的迭代签名算法 | ||
tissues.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | 分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 1.8.2 |
Bioconductor自 | BioC 2.6 (R-2.11)(6年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | 方法,isa2,Biobase,AnnotationDbi,类别,genefilter,DBI |
进口 | |
链接 | |
建议 | igraph0 (> = 0.5.5),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db,targetscan.Hs.eg.db,org.Hs.eg.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | ExpressionView |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | eisa_1.8.2.tar.gz |
Windows二进制 | eisa_1.8.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/eisa/tree/release-2.10 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/ |
包下载报告 | 下载数据 |