要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)

在大多数情况下,根本不需要下载包存档。

eisa

这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见eisa

通过迭代签名算法进行表达式数据分析

Bioconductor版本:2.10

迭代签名算法(ISA)是一种双聚类算法;它在基因表达(或其他表格)数据中发现相关的块(转录模块)。ISA能够发现重叠的模块,并且对噪声有弹性。这个包提供了ISA的方便接口,使用标准的BioConductor数据结构;还包含各种可视化工具,可以与其他双聚类算法一起使用。

作者:Gabor Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >

维护者:Gabor Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >

引文(从R中输入引用(eisa)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (eisa)

PDF ISA_internals.pdf
PDF eisa和biclust的包裹
PDF 基因表达数据的迭代签名算法
PDF tissues.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类GeneExpression微阵列软件可视化
版本 1.8.2
Bioconductor自 BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 方法,isa2BiobaseAnnotationDbi类别genefilterDBI
进口
链接
建议 igraph0 (> = 0.5.5),矩阵GOstatsGO.dbKEGG.dbbiclust质量xtable所有hgu95av2.dbtargetscan.Hs.eg.dborg.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 ExpressionView
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 eisa_1.8.2.tar.gz
Windows二进制 eisa_1.8.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/eisa/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题张贴到以下地点之一:

  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈金森癌症研究中心