要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ edger”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

EDGER

此软件包适用于生物导体的2.10版;对于稳定的最新版本,请参阅EDGER

R中数字基因表达数据的经验分析

生物导体版本:2.10

具有生物复制的RNA-SEQ和数字基因表达谱的差异表达分析。使用基于负二项式分布的经验贝叶斯估计和精确测试。还适用于与其他类型的基因组规模计数数据的差异信号分析。

作者:马克·罗宾逊(Mark Robinson),戴维斯·麦卡锡(Davis McCarthy

维护人员:马克·罗宾逊(Mark Robinson),戴维斯·麦卡锡(Davis McCarthy),yunshun chen chen ,gordon smyth

引用(从r内,输入引用(“ Edger”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Edger”)

PDF Edger Vignette
PDF Edgerusersguide.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物信息学,,,,chipseq,,,,差异性,,,,高通量序列,,,,rnaseq,,,,智者,,,,软件
版本 2.6.12
在生物导体中 Bioc 2.3(R-2.8)(7。5年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 r(> = 2.3.0),方法,林玛
进口
链接
建议 大量的,,,,Statmod,花键
系统要求
增强
URL
取决于我 EasyRnaseq,,,,蝠ta
进口我 arrayexpresshts,,,,差异,,,,repitools,,,,RNASEQMAP,,,,Tweedeseq
建议我 贝塞克,,,,CQN,,,,EDASEQ,,,,基因组机,,,,Goseq,,,,GSVA,,,,Leebamviews,,,,Onechannelgui,,,,帕西拉,,,,repitools
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 edger_2.6.12.tar.gz
Windows二进制 edger_2.6.12.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/edger/tree/release-2.10
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/edger/
软件包下载报告 下载统计

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弗雷德·哈钦森癌症研究中心