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EasyRnaseq
  |
此软件包适用于生物导体的2.10版；对于稳定的最新版本，请参阅EasyRnaseq。
计数RNA-seq数据的汇总和归一化。
生物导体版本：2.10
计算高通量短阅读对参考基因组的覆盖范围，并根据感兴趣的特征总结其（例如外显子，基因，转录本）。数据可以标准化为“ RPKM”或“ DESEQ”或“ EDGER”软件包。
作者：Ismael Padioleau的Nicolas Delhomme
维护者：nicolas delhomme
引用（从r内，输入引用（“ easyrnaseq”））：
安装
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文档
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browsevignettes（“ easyrnaseq”）
| RNA-seq | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基因表达，，，，遗传学，，，，预处理，，，，rnaseq，，，，软件 |
| 版本 | 1.2.5 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.10（R-2.15）（4年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 图形，方法，并行，utils，基因组合（> = 1.12.0），生物酶（> = 2.16.0），生物基因（> = 0.2.0），Biomart（> = 2.12.0），EDGER（> = 2.6.10），生物弦（> = 2.24.1），BSGENOME（> = 1.24.0），deseq（> = 1.8.3），基因组机（> = 1.8.12），iranges（> = 1.14.4），rsamtools（> = 1.8.6），Shortread（> = 1.14.4） |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3（> = 1.3.17），GenomicFeatures（> = 1.8.2），rnaseqtutorial（> = 0.0.8） |
| 系统要求 | |
| 增强 | EDGER，，，，基因组合，，，，deseq，，，，Shortread |
| URL | |
| 取决于我 | rnaseqtutorial |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | easyrnaseq_1.2.5.5.tar.gz |
| Windows二进制 | easyrnaseq_1.2.5.5 zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/easyrnaseq/tree/release-2.10 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/easyrnaseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
