##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“染料偏见”)

这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本，请参见dyebias。

用于校正幻灯片依赖基因特异性染料偏倚的GASSCO方法

Bioconductor版本:2.10

许多双色杂交遭受染料偏倚，这是基因特异性和玻片特异性。前者取决于用于标记的核苷酸的含量;后者取决于标注百分比。到目前为止，幻灯片依赖性还没有被认识到，这使得解决人工制品成为不可能。如果有合理数量的染料交换杂交对，或者相同的杂交对相同的杂交，可以使用GASSCO方法估计和校正基因偏差和幻灯片偏差(Margaritis et al.， Mol. Sys.)。生物杂志。5:266 (2009)，doi:10.1038/msb.2009.21)

作者:Philip Lijnzaad和Thanasis Margaritis

维护人员:Philip Lijnzaad

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“染料偏见”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“dyebias”)

PDF		染料偏差纠正
PDF		dyebiasCompleteVignette.pdf
PDF		gassco.pdf
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 1.4.1),marray,Biobase
进口
链接
建议	limma,转换,GEOquery,dyebiasexamples、方法
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad
取决于我
进口我
建议我	dyebiasexamples
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	dyebias_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	dyebias_1.14.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/dyebias/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/
包下载报告	下载数据