要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“CRLMM”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

CRLMM.

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅CRLMM.

基因型调用(CRLMM)和Affymetrix SNP 5.0和6.0和Illumina阵列的复制编号分析工具。

生物导体版本:2.10

更快地实现CRLMM特定于SNP 5.0和6.0阵列,以及特定于5.0,6.0和Illumina平台的副本编号工具

作者:Benilton S Carvalho,Robert Scharpf,Matt Ritchie,Ingo Ruczinski,Rafael A Ireizarry

维护者:Benilton S Carvalho ,Robert Scharpf ,Matt Ritchie

引文(从R内,输入引文(“CRLMM”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“CRLMM”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“CRLMM”)

PDF. 复制号码估计
PDF. CRLMM Vignette - 下游分析
PDF. CRLMM Vignette - 基因分型
PDF. 用于拷贝数分析的基础架构
PDF. 副本数概述Vignettes
PDF. 用于拷贝数分析的预处理和基因分型illumina阵列
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 生物信息学Copynumbervariants.微阵列预处理SNP.软件
版本 1.14.3.
在生物导体中以来 BIOC 2.4(R-2.9)(7年)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 2.14.0),oligoclasses.(> = 1.18.0)
进口 方法,BioBase.(> = 2.15.4),生物根系挚友(> = 1.23.2),椭圆Genefilter.(> = 1.37.1),mvtnorm.预处理核(> = 1.17.7),样条,统计,SNPCHIP.,实用,格子FF.Foreach.
链接到
建议 hapmapsnp6.Genomewidesnp6crlmm.(> = 1.0.4),ggdata.Snpstats.椭圆运行
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我 Minfi.香草
建议我 hapmap370k.SNPCHIP.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 crlmm_1.14.3.tar.gz.
Windows二进制文件 crlmm_1.14.3.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/crlmm/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/crlmm/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网
Fred Hutchinson癌症研究中心