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此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅CRLMM.。
生物导体版本:2.10
更快地实现CRLMM特定于SNP 5.0和6.0阵列,以及特定于5.0,6.0和Illumina平台的副本编号工具
作者:Benilton S Carvalho,Robert Scharpf,Matt Ritchie,Ingo Ruczinski,Rafael A Ireizarry
维护者:Benilton S Carvalho
引文(从R内,输入引文(“CRLMM”)
):
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BROWSEVIGNETTES(“CRLMM”)
PDF. | 复制号码估计 | |
PDF. | CRLMM Vignette - 下游分析 | |
PDF. | CRLMM Vignette - 基因分型 | |
PDF. | 用于拷贝数分析的基础架构 | |
PDF. | 副本数概述Vignettes | |
PDF. | 用于拷贝数分析的预处理和基因分型illumina阵列 | |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 生物信息学那Copynumbervariants.那微阵列那预处理那SNP.那软件 |
版本 | 1.14.3. |
在生物导体中以来 | BIOC 2.4(R-2.9)(7年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 2.14.0),oligoclasses.(> = 1.18.0) |
进口 | 方法,BioBase.(> = 2.15.4),生物根系那挚友(> = 1.23.2),椭圆那Genefilter.(> = 1.37.1),mvtnorm.那预处理核(> = 1.17.7),样条,统计,SNPCHIP.,实用,格子那FF.那Foreach. |
链接到 | |
建议 | hapmapsnp6.那Genomewidesnp6crlmm.(> = 1.0.4),ggdata.那Snpstats.那椭圆那运行 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | Minfi.那香草 |
建议我 | hapmap370k.那SNPCHIP. |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | crlmm_1.14.3.tar.gz. |
Windows二进制文件 | crlmm_1.14.3.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/crlmm/tree/release-2.10 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/crlmm/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |