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这个包是2.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅chipseq。

为分析chipseq chipseq:一个包的数据

Bioconductor版本:2.10

工具帮助chipseq实验过程短的读取数据

作者:Deepayan Sarkar,罗伯特先生,迈克尔•劳伦斯Zizhen姚明

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“chipseq”)

文档

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browseVignettes (“chipseq”)

PDF		一个示例ChIP-Seq分析工作流
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPseq,软件
版本	1.6.1
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.10),方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.4),GenomicRanges(> = 1.7.7),BSgenome,ShortRead
进口	方法,BiocGenerics,IRanges,BSgenome,GenomicRanges,晶格,ShortRead,统计数据
链接
建议	GenomicFeatures,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	平
进口我
建议我	oneChannelGUI
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	chipseq_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	chipseq_1.6.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/chipseq/tree/release - 2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipseq/
包下载报告	下载数据