要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“魅力”)

在大多数情况下,根本不需要下载包存档。

魅力

这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见魅力

来自CHARM微阵列的DNA甲基化数据分析

Bioconductor版本:2.10

该软件包实现了使用Nimblegen微阵列和McrBC协议生成的DNA甲基化数据的分析工具。它发现样品之间的差异甲基化区域,计算甲基化估计百分比,并包括阵列质量评估工具。

作者:Martin Aryee, Peter Murakami, Harris Jaffee, Rafael Irizarry

维护者:Martin Aryee < Aryee at jhu.edu>

引文(从R中输入引用(“魅力”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“魅力”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“魅力”)

PDF 魅力装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学DNAMethylation微阵列软件
版本 2.2.0
Bioconductor自 BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.14.0),BiobaseSQN字段RColorBrewergenefilter
进口 BSgenomeBiobase益生元(> = 1.11.31),oligoClasses(> = 1.17.39),ffpreprocessCore、方法、统计数据BiostringsIRangessiggenesnor1mixgtools、grDevices、graphics、utils、limma平行,股东价值分析(> = 3.1.2)
链接
建议 charmDataBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 charmData
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 charm_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 charm_2.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/charm/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/charm/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题张贴到以下地点之一:

  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈金森癌症研究中心