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此包适用于Bioconductor的2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见cellHTS2．

细胞筛选的分析- cellHTS的修订版

Bioconductor版本:2.10

该软件包提供了在384孔微滴定板(或类似的)格式中进行的高通量分析的工具。功能包括数据导入和管理、规范化、质量评估、复制总结和统计评分。生成了一个网页，提供了数据和分析结果的详细图形化概述。在我们的工作中，我们已经将该软件包应用于苍蝇和人类细胞的RNAi筛选，以及酵母文库的筛选。参见?cellHTS2获得简要介绍。

作者:Ligia Bras, Wolfgang Huber ， Michael Boutros ， Gregoire Pau ， Florian Hahne < Florian。哈恩在novartis.com>

维护者:Joseph Barry < Joseph。巴里在embl.de>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("cellHTS2")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“cellHTS2”)

PDF		主要插图(完整版本):基于单元格的屏幕的端到端分析
PDF		主要插图:基于单元格的屏幕的端到端分析
PDF		补充:增强-抑制筛选
PDF		补充:多通道检测
PDF		参考手册

细节

biocViews	CellBasedAssays，预处理，软件，可视化
版本	2.20.0
在Bioconductor公司	BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，RColorBrewer，Biobase、方法、genefilter，splots，vsn，hwriter，locfit、网格
进口	普拉达，GSEABase，类别, stats4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber
全靠我	coRNAi，HTSanalyzeR，imageHTS
进口我	HTSanalyzeR，RNAinteract
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	cellHTS2_2.20.0.tar.gz
Windows二进制	cellHTS2_2.20.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/cellHTS2/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellHTS2/
软件包下载报告	下载数据