要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“pategorycompare”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

CompoundationCompare.

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅CompoundationCompare.

使用特征注释的高通量实验的Meta分析

生物导体版本:2.10

Calculates significant annotations (categories) in each of two (or more) feature (i.e. gene) lists, determines the overlap between the annotations, and returns graphical and tabular data about the significant annotations and which combinations of feature lists the annotations were found to be significant. Interactive exploration is facilitated through the use of RCytoscape (heavily suggested).

作者:罗伯特M.航班

维护者:Robert M. Flight

引文(从R内,输入引文(“PategoryCompare”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“pategorycompare”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“PACEALCOMPARE”)

PDF. CompoundationCompare:使用基因注释的高吞吐量数据元分析
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 注解生物信息学基因表达多重组块途径软件
版本 1.0.2
在生物导体中以来 BIOC 2.10(R-2.15)(4年)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 2.10),BioBase.(> = 1.15.29),annotationdbi.(> = 0.1.15),类别
进口 BioBase.(> = 1.15.29),annotationdbi.(> = 0.1.15),HWRITER.GSEABASE.类别(> = 2.21.2),古司裤注释色彩空间图形rcytoscape.(> = 1.5.11)
链接到
建议 方法,GSEABASE.HWRITER.色彩空间图形go.db.kegg.db.雌激素org.hs.eg.db.hgu95av2.db.林马敬服Genefilter.
系统要求 cytoscape(> = 2.8.0)(如果用于可视化结果,大量建议),Cytoscapepc插件(> = 1.8)
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 compouttscompare_1.0.2.tar.gz.
Windows二进制文件 categoryCompare_1.0.2.zip.
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/categorycompare/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/categoryCompare/
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生物体

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