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##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“pategorycompare”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅CompoundationCompare.。
生物导体版本:2.10
Calculates significant annotations (categories) in each of two (or more) feature (i.e. gene) lists, determines the overlap between the annotations, and returns graphical and tabular data about the significant annotations and which combinations of feature lists the annotations were found to be significant. Interactive exploration is facilitated through the use of RCytoscape (heavily suggested).
作者:罗伯特M.航班
维护者:Robert M. Flight
引文(从R内,输入引文(“PategoryCompare”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“pategorycompare”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“PACEALCOMPARE”)
PDF. | CompoundationCompare:使用基因注释的高吞吐量数据元分析 | |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 注解那生物信息学那去那基因表达那多重组块那途径那软件 |
版本 | 1.0.2 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.10(R-2.15)(4年) |
执照 | GPL-2 |
依靠 | r(> = 2.10),BioBase.(> = 1.15.29),annotationdbi.(> = 0.1.15),类别 |
进口 | BioBase.(> = 1.15.29),annotationdbi.(> = 0.1.15),HWRITER.那GSEABASE.那类别(> = 2.21.2),古司裤那注释那色彩空间那图形那rcytoscape.(> = 1.5.11) |
链接到 | |
建议 | 方法,GSEABASE.那HWRITER.那色彩空间那图形那go.db.那kegg.db.那雌激素那org.hs.eg.db.那hgu95av2.db.那林马那敬服那Genefilter. |
系统要求 | cytoscape(> = 2.8.0)(如果用于可视化结果,大量建议),Cytoscapepc插件(> = 1.8) |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | compouttscompare_1.0.2.tar.gz. |
Windows二进制文件 | categoryCompare_1.0.2.zip. |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/categorycompare/tree/release-2.10 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/categoryCompare/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |