要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见beadarray。
Bioconductor版本:2.10
该包能够读取珠子级数据(原始tiff和文本文件)输出的BeadScan以及珠子总结数据从BeadStudio。提供了质量评价和低层次分析的方法。
作者:马克·邓宁,迈克·史密斯,乔纳森·凯恩斯,安迪·林奇,马特·里奇
维护人员:Mark Dunning
引文(从R中输入引用(“beadarray”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“beadarray”)
beadarray.pdf | ||
beadlevel.pdf | ||
beadsummary.pdf | ||
ImageProcessing.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,软件 |
版本 | 2.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.8 (R-2.3)(10年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 2.13.0),Biobase(> = 2.5.5)、方法ggplot2 |
进口 | BeadDataPackR,limma,AnnotationDbistats4,BiocGenerics,reshape2 |
链接 | |
建议 | 光民,vsn,affy,hwriter,beadarrayExampleData,illuminaHumanv3.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | beadarrayExampleData |
进口我 | arrayQualityMetrics,BeadArrayUseCases |
建议我 | beadarraySNP,光民 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | beadarray_2.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | beadarray_2.6.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/beadarray/tree/release-2.10 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/ |
包下载报告 | 下载数据 |