要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)

在大多数情况下,根本不需要下载包存档。

beadarray

这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见beadarray

Illumina BeadArray数据的质量评估和低水平分析

Bioconductor版本:2.10

该包能够读取珠子级数据(原始tiff和文本文件)输出的BeadScan以及珠子总结数据从BeadStudio。提供了质量评价和低层次分析的方法。

作者:马克·邓宁,迈克·史密斯,乔纳森·凯恩斯,安迪·林奇,马特·里奇

维护人员:Mark Dunning

引文(从R中输入引用(“beadarray”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“beadarray”)

PDF beadarray.pdf
PDF beadlevel.pdf
PDF beadsummary.pdf
PDF ImageProcessing.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,软件
版本 2.6.0
Bioconductor自 BioC 1.8 (R-2.3)(10年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 2.13.0),Biobase(> = 2.5.5)、方法ggplot2
进口 BeadDataPackR,limma,AnnotationDbistats4,BiocGenerics,reshape2
链接
建议 光民,vsn,affy,hwriter,beadarrayExampleData,illuminaHumanv3.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 beadarrayExampleData
进口我 arrayQualityMetrics,BeadArrayUseCases
建议我 beadarraySNP,光民
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 beadarray_2.6.0.tar.gz
Windows二进制 beadarray_2.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/beadarray/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。将有关Bioconductor的问题张贴到以下地点之一:

  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈金森癌症研究中心