要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("arrayQualityMetrics")

在大多数情况下,根本不需要下载包存档。

arrayQualityMetrics

这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见arrayQualityMetrics

微阵列数据集的质量指标

Bioconductor版本:2.10

这个包生成微阵列质量指标报告的数据在Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)。报告包含一般部分和平台特定部分。支持一种和两种颜色阵列平台。

作者:奥黛丽·考夫曼,沃尔夫冈·休伯

维护人:奥黛丽·考夫曼

引文(从R中输入引用(“arrayQualityMetrics”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("arrayQualityMetrics")

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)

PDF 高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理
PDF 简介:arrayQualityMetrics芯片质量评估
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel质量控制ReportWriting软件TwoChannel
版本 3.12.0
Bioconductor自 BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于
进口 affyaffyPLM(> = 1.27.3),beadarrayBiobase开罗(> = 1.4 6),genefilter、图形、grDevices、网格、Hmischwriter晶格latticeExtralimma、方法、RColorBrewersetRNGsimpleaffy、stats、SVGAnnotation(>= 0.9-0)、utils、vsn(> = 3.23.3),XML
链接
建议 ALLMLL亚兰
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 arrayQualityMetrics_3.12.0.tar.gz
Windows二进制 arrayQualityMetrics_3.12.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/arrayQualityMetrics/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题张贴到以下地点之一:

  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈金森癌症研究中心