要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("arrayQualityMetrics")
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本,请参见arrayQualityMetrics.
Bioconductor版本:2.10
这个包生成微阵列质量指标报告的数据在Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)。报告包含一般部分和平台特定部分。支持一种和两种颜色阵列平台。
作者:奥黛丽·考夫曼,沃尔夫冈·休伯
维护人:奥黛丽·考夫曼
引文(从R中输入引用(“arrayQualityMetrics”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("arrayQualityMetrics")
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)
高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理 | ||
简介:arrayQualityMetrics芯片质量评估 | ||
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,质量控制,ReportWriting,软件,TwoChannel |
版本 | 3.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年) |
许可证 | LGPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | affy,affyPLM(> = 1.27.3),beadarray,Biobase,开罗(> = 1.4 6),genefilter、图形、grDevices、网格、Hmisc,hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、RColorBrewer,setRNG,simpleaffy、stats、SVGAnnotation(>= 0.9-0)、utils、vsn(> = 3.23.3),XML |
链接 | |
建议 | ALLMLL,亚兰 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | arrayQualityMetrics_3.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | arrayQualityMetrics_3.12.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/arrayQualityMetrics/tree/release-2.10 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/ |
包下载报告 | 下载数据 |