要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“注释”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

注释

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅注释

微阵列注释

生物导体版本:2.10

使用r Enviroments进行注释。

作者:r.绅士

维护者:Bioconductor Package维护者

引文(从R内,输入引文(“注释”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“注释”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“annotate”)

PDF. 注释概述
PDF. 基本的使用
PDF. HOWTO:获取HTML输出
PDF. HOWTO:使用染色体信息
PDF. HOWTO:使用在线查询工具
PDF. 使用Affymetrix探测级别数据
PDF. 使用数据包
PDF. 使用同源包
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 注解途径软件
版本 1.34.1.
在生物导体中以来 BIOC 1.6(R-2.1)或更早版本(> 11年)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 2.10),annotationdbi.(> = 0.1.15)
进口 BioBase.annotationdbi.DBI.xtable.,图形,实用程序,统计数据,方法,XML.(> = 0.92-2)
链接到
建议 BioBase.hgu95av2.db.Genefilter.生物仪器(> = 2.4.4),Rae230a.db.Rae230aprobe.TKWidgets.XML.(> = 0.92-2),go.db.org.hs.eg.db.org.mm.eg.db.hom.hs.inp.db.孵化器rghrachviz
系统要求
加强
URL.
取决于我 AGI4X44Prepess.ChromheatMap.Geneanswers.Geneplotter.GSEABASE.Idiogram.马特ml interfaces.Neve2006.PCHENO.现象预先predasampledata.rpsixml.安全的scisi.
进口我 倍感工具类别CompoundationCompare.ChromheatMap.Codelink.Geneanswers.Genefilter.Genegrounalysis.Geneplotter.Globalancova全球化境古司裤GSEABASE.lumi.弥撒现象QPGraph..安全的scisi.剪接蒂格雷
建议我 Adme16cod.db.ag.db.ATH1121501.DB.Bioccasestudies.生物雕Bovine.DB.canine.db.canine2.db.celegans.db.Chicken.DB.drosgenome1.db.果蝇2.db.Ecoli2.db.Geneplotter.gghumanmethcancerpanelv1.db.Globalancova全球化境古司裤GSEALMh10kcod.db.H20KCOD.DB.hcg110.db.hgfocus.db.hgu133a.db.hgu133a2.db.hgu133b.db.hgu133plus2.db.hgu219.db.hgu95a.db.hgu95av2.db.hgu95b.db.hgu95c.db.hgu95d.db.hgu95e.db.hguatlas13k.db.hgubeta7.db.hgudkfz31.db.hgug4100a.db.hgug4101a.db.hgug4110b.db.hgug4111a.db.hgug4112a.db.hgug4845a.db.Hguqiagenv3.db.hi16cod.db.hs25kresogen.db.hs6ug171.db.hsagilentdesign026652.db.hthgu133a.db.hthgu133b.db.hu35ksuba.db.hu35ksubb.db.hu35ksubc.db.hu35ksubd.db.hu6800.db.hugene10stprobeset.db.hugene10sttranscriptcluster.db.hugene11stprobeset.db.hugene11sttranscriptcluster.db.HUO22.DB.hwgcod.db.Illuminahumanmethylation27k.db.illuminahumanmethylation450k.db.illiminahumanv1.db.illiminahumanv2.db.illuminahumanv2beadid.db.illuminahumanv3.db.illiminahumanv4.db.illuminahumanwgdaslv3.db.illuminahumanwgdaslv4.db.Illuminamousev1.db.Illuminamousev1p1p1.db.Illuminamousev2.db.Illuminaratv1.db.Indac.DB.jazaerimetadata.db.lapointe.db.lumihumanall.db.lumimouseall.db.lumiratall.db.m10kcod.db.m20kcod.db.maigespack.mgu74a.db.mgu74av2.db.mgu74b.db.mgu74bv2.db.mgu74c.db.mgu74cv2.db.mguatlas5k.db.mgug4104a.db.mgug4120a.db.mgug4121a.db.mgug4122a.db.mi16cod.db.MLP.mm24kresogen.db.mmagilentdesign026655.db.moe430a.db.moe430b.db.mogene10stprobeset.db.mogene10sttranscriptcluster.db.mogene11stprobeset.db.mogene11sttranscriptcluster.db.mouse4302.db.mouse430a2.db.mpedbarray.db.mu11ksuba.db.mu11ksubb.db.mu15v1.db.mu19ksuba.db.mu19ksubb.db.mu19ksubc.db.mu22v3.db.mwgcod.db.挪威981.db.nugohs1a520180.db.nugomm1a520177.db.onechannelgui.operonhumanv3.db.org.ag.eg.db.org.at.tair.db.org.bt.eg.db.org.ce.eg.db.org.cf.eg.db.org.dm.eg.db.org.dr.eg.db.org.eck12.eg.db.org.ecsakai.eg.db.org.gg.eg.db.org.hs.eg.db.org.mm.eg.db.org.mmu.eg.db.org.pf.plasmo.db.org.pt.eg.db.org.rn.eg.db.org.sc.sgd.db.org.sco.eg.db.org.ss.eg.db.org.tgondii.eg.db.org.xl.eg.db.partheenmetadata.db.pedbarrayv10.db.pedbarrayv9.db.pocrcannotation.db.porcine.db.彪马r10kcod.db.Rae230a.db.Rae230b.db.ragene10stprobeset.db.ragene10sttranscriptcluster.db.ragene11stprobeset.db.ragene11sttranscriptcluster.db.rat2302.db.rgu34a.db.rgu34b.db.rgu34c.db.Rguatlas4k.db.rgug4105a.db.rgug4130a.db.rgug4131a.db.RI16COD.DB.rnagilentdesign028282.db.rnu34.db.Roberts2005Annotation.db.RTU34.DB.rwgcod.db.shdz.db.siggenes.蒂格雷U133x3p.db.xlaevis.db.yeast2.db.YGS98.DB.Zebrafish.DB.
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包档案包

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包来源 annotate_1.34.1.tar.gz.
Windows二进制文件 annotate_1.34.1.zip.
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/annotate/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/annotate/
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