要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("affxparser")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affxparser.
Bioconductor版本:2.10
用于解析Affymetrix文件(CDF, CEL, CHP, BPMAP, BAR)的包。它提供了使用Affymetrix的Fusion SDK对Affymetrix文件进行快速和内存高效解析的方法。支持基于ASCII和基于二进制的文件。目前,有读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以全部读,也可以部分读。例如,可以非常快速地从一组CEL文件中提取来自几个探测集的探测信号到一个方便的列表结构中。
作者:Henrik Bengtsson, James Bullard, Robert Gentleman, Kasper Daniel Hansen, Martin Morgan
维护者:Kasper Daniel Hansen
引用(从R中,输入引用(“affxparser”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("affxparser")
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,基础设施,软件 |
版本 | 1.28.1 |
在Bioconductor公司 | BioC 1.7 (R-2.2)(10.5年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.6.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | R.utils(> = 1.9.11),AffymetrixDataTestFiles |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | 斜体,pdInfoBuilder,rMAT,斯塔尔 |
进口我 | affyILM,AffyTiling,cn.farms,GeneRegionScan,斜体,益生元,rMAT |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | affxparser_1.28.1.tar.gz |
Windows二进制 | affxparser_1.28.1.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/affxparser/tree/release-2.10 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/affxparser/ |
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