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vegamc
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此软件包适用于生物导体的2.10版；对于稳定的最新版本，请参阅vegamc。
VEGAMC：实现各种分段平滑模型的软件包，以识别癌症驱动染色体失衡
生物导体版本：2.10
该软件包可以检测驱动染色体失衡，包括阵列比较基因组杂交（ACGH）数据中的杂合性丧失（LOH）。VEGAMC执行数据集的联合分割，并使用统计框架来区分驾驶员和乘客突变。VEGAMC已实施，以便可以立即与PennCNV工具产生的输出集成。此外，VEGAMC在输出两个网页中产生，可以在检测到的区域和改变的基因之间快速导航。在总结了变化基因的网页中，报告了指向各个Ensembl基因网页的链接。
作者：S。Morganella和M. Ceccarelli
维护者：sandro Morganella
引用（从r内，输入引用（“ vegamc”））：
安装
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文档
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browsevignettes（“ vegamc”）
| vegamc | ||
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 生物信息学，，，，库务，，，，dnacopynumber，，，，软件，，，，ACGH |
| 版本 | 2.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.10（R-2.15）（4年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 2.10.0），Biomart，，，，生物酶，，，，Genoset |
| 进口 | 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | VEGAMC_2.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | vegamc_2.0.0.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/vegamc/tree/release-2.10 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/vegamc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
