要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“TEQC”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

TEQC.

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅TEQC.

目标捕获实验的质量控制

生物导体版本:2.10

靶捕获实验将基于杂交的(在溶液或微阵列中)捕获和富集基因组区域(例如exome)的捕获和富集,具有捕获的DNA片段的高通量测序。该包提供了评估和可视化目标浓缩过程质量的功能,如捕获,每目标读取覆盖等特异性和敏感性等等。

作者:M. Hummel,S.Bonnin,E.Lowy,G. Roma

维护者:Manuela Hummel

引文(从R内,输入引文(“TEQC”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“TEQC”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“TEQC”)

PDF. TEQC.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 生物信息学遗传学Highthrougputsequencing.微阵列QualityControl.软件
版本 2.4.0
在生物导体中以来 BIOC 2.8(R-2.13)(5年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 方法,生物根系(> = 0.1.0),绞喉(> = 1.13.5),RSAMTOOLS.HWRITER.
进口 BioBase.(> = 2.15.1)
链接到
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 teqc_2.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件 teqc_2.4.0.zip.
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondudard-mirror/teqc/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/teqc/
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