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此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅林诺。
生物导体版本:2.10
Packing Ringo促进了芯片芯片数据的主要分析。包装的主要功能是芯片芯片中富集的基因组区域的数据读数,质量评估,数据可视化和识别。该包装具有从芯片芯片项目中使用的nimblegen处理的双色寡核苷酸微阵列,但还包含更多的芯片芯片数据分析功能,因为数据被提供为rglist(原始)或表达式(pre-处理)。该包装采用来自生物导体项目的各种其他包装的功能,并提供额外的芯片芯片特异性和Nimble的特定功能。
作者:乔塞塞德林,奥格斯斯利格,塔克·克鲁格,马特里奇,沃尔夫冈·沃特
维护者:J. Toedling
引文(从R内,输入引文(“戒指”)
):
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Browsevignettes(“林诺”)
PDF. | R调查Nimblegen OligoArrays | |
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | DataImport.那微阵列那预处理那QualityControl.那软件那两种通道 |
版本 | 1.20.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.0(R-2.5)(9年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | 方法,BioBase.(> = 1.14.1),rcolorbrewer.那林马那矩阵, 网格 |
进口 | 生物根系(> = 0.1.11),Genefilter.那林马那VSN.,统计数据4. |
链接到 | |
建议 | rtracklayer.(> = 1.3.1),蒙链那顶点(> = 1.15.0) |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | CcTutorial.那斯塔尔 |
进口我 | repitools. |
建议我 | repitools. |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | ringo_1.20.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | ringo_1.20.0.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocondudard-mirror/ringo/tree/release-2.10 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/ringo/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |