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林诺

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅林诺

钙芯片Oligoarrays的R调查

生物导体版本:2.10

Packing Ringo促进了芯片芯片数据的主要分析。包装的主要功能是芯片芯片中富集的基因组区域的数据读数,质量评估,数据可视化和识别。该包装具有从芯片芯片项目中使用的nimblegen处理的双色寡核苷酸微阵列,但还包含更多的芯片芯片数据分析功能,因为数据被提供为rglist(原始)或表达式(pre-处理)。该包装采用来自生物导体项目的各种其他包装的功能,并提供额外的芯片芯片特异性和Nimble的特定功能。

作者:乔塞塞德林,奥格斯斯利格,塔克·克鲁格,马特里奇,沃尔夫冈·沃特

维护者:J. Toedling

引文(从R内,输入引文(“戒指”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“ringo”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“林诺”)

PDF. R调查Nimblegen OligoArrays
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. DataImport.微阵列预处理QualityControl.软件两种通道
版本 1.20.0
在生物导体中以来 BIOC 2.0(R-2.5)(9年)
执照 艺术-2.0
依靠 方法,BioBase.(> = 1.14.1),rcolorbrewer.林马矩阵, 网格
进口 生物根系(> = 0.1.11),Genefilter.林马VSN.,统计数据4.
链接到
建议 rtracklayer.(> = 1.3.1),蒙链顶点(> = 1.15.0)
系统要求
加强
URL.
取决于我 CcTutorial.斯塔尔
进口我 repitools.
建议我 repitools.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 ringo_1.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件 ringo_1.20.0.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondudard-mirror/ringo/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/ringo/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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