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此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见红色的．

弥合层次网络表示和功能分析之间的差距。

Bioconductor版本:2.10

RedeR是一个基于r的包，结合了一个独立的Java应用程序，用于动态网络可视化和操作。它通过使用低级的R-to-Java接口来构建和运行公共插件来实现回调引擎。从这个意义上说，RedeR利用R来运行健壮的统计，而R到Java的接口弥合了网络分析和可视化之间的差距:对于R开发者来说，它允许专门使用R代码开发Java插件;bob电竞体育官网对于Java用户，它运行在一个独立的应用程序中实现的R方法，对于R用户，RedeR使用嵌入在这个包中的健壮的Java图形引擎交互式地显示R图形。

作者:Mauro Castro, Wang Xin, Florian Markowetz

维护者:Mauro Castro < Mauro .a.。卡斯特罗在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“阅读器”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“红”)

PDF		fig1.pdf
PDF		fig2.pdf
PDF		fig3.pdf
PDF		fig4.pdf
PDF		fig5a.pdf
PDF		fig5b.pdf
PDF		fig5c.pdf
PDF		fig6.pdf
PDF		主要插图:阅读器概述
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI，GraphsAndNetworks，软件，可视化
版本	1.2.5
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.15)， igraph0，RCurl，XML, XMLRPC
进口	rJava、方法
链接
建议	PANR，HTSanalyzeR，pvclust，图
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.markowetzlab.org/software/networks.html
全靠我
进口我	Mulder2012
建议我	PANR
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	RedeR_1.2.5.tar.gz
Windows二进制	RedeR_1.2.5.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/RedeR/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RedeR/
软件包下载报告	下载数据