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此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ReactomePA．

反应组通路分析

Bioconductor版本:2.10

该包提供了基于REACTOME路径数据库的路径分析功能。它将实现富集分析、基因集富集分析和功能模块检测。

作者:guangchuangyu

维护人员:guangchuangyu

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ReactomePA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ReactomePA”)

PDF		ReactomePA简介
PDF		cnetplot.pdf
PDF		rPAclusterProfiler.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，通路，软件，可视化
版本	1.0.1
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(4年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	方法,AnnotationDbi，reactome.dbstats4,plyrigraph0,qvalue、图形、org.Hs.eg.db
链接
建议	clusterProfiler，剂量，GOSemSim
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	clusterProfiler，剂量
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	ReactomePA_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	ReactomePA_1.0.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/ReactomePA/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ReactomePA/
软件包下载报告	下载数据