要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("REDseq")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

REDseq

此包适用于Bioconductor的2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见REDseq

酶切处理的高通量测序数据分析

Bioconductor版本:2.10

该软件包包括构建限制性内切酶切位(RECS)地图、用五种不同的方法将映射的序列分布在地图上、寻找样本的富集/缺失RECSs以及识别样本之间差异富集/缺失RECSs的功能。

作者:朱丽华、Thomas Fazzio

维护者:朱莉朱丽华<朱莉。@ umassmed.edu>

引用(从R中,输入引用(“REDseq”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("REDseq")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“REDseq”)

PDF REDseq装饰图案
PDF 参考手册

细节

biocViews 预处理SequenceMatching测序软件
版本 1.2.0
在Bioconductor公司 BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 2.14.0),BiocGenerics(> = 0.1.0),BSgenome.Celegans.UCSC.ce2BiostringsBSgenomeChIPpeakAnno
进口 BiocGenericsAnnotationDbiBiostringsChIPpeakAnno、图形、IRanges(> = 1.13.5),,统计,效用
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 REDseq_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 REDseq_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/REDseq/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/REDseq/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心