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此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MEDIPS．

MeDIP-Seq数据分析

Bioconductor版本:2.10

MEDIPS用于分析甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP)实验数据，然后进行测序(MeDIP- seq)。然而，质量控制等功能可应用于其他类型的测序数据(例如ChIP-Seq)。MEDIPS在MeDIP-Seq数据分析的背景下解决了几个方面的问题。

作者:卢卡斯·查韦斯，乔恩·迪特里希

维护者:Lukas Chavez < Chavez at molgen.mpg.de>

安装

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文档

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PDF		MEDIPS
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPseq，CpGIsland，DNAMethylation，DifferentialExpression，HighThroughputSequencing，Methylseq，预处理，质量控制，测序，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 2.12.0)，BiocGenerics(> = 0.1.3),BSgenome
进口	方法,BiocGenerics，Biostrings，BSgenome、图形、gtools，IRanges，统计，效用
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	MEDIPS_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	MEDIPS_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/MEDIPS/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MEDIPS/
软件包下载报告	下载数据