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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ Genomicranges”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

基因组机

此软件包适用于生物导体的2.10版;对于稳定的最新版本,请参阅基因组机

基因组间隔的表示和操纵

生物导体版本:2.10

在分析高通量测序数据(又称NGS数据)时,有效存储基因组注释和比对的能力正在发挥核心作用。该软件包定义了用于存储基因组间隔的通用容器以及更专业的容器,以存储针对参考基因组的比对。

作者:P。Aboyoun,H。Pages和M. Lawrence

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“基因组”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ Genomicranges”)

文档

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Browsevignettes(“基因组旋翼”)

PDF 基因组介绍
PDF Genomicranges用例
PDF 重叠编码
PDF 总结概述
PDF SumparizeOverLaps-modes.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,遗传学,,,,高通量序列,,,,测序,,,,软件
版本 1.8.13
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(6年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.10),方法,生物基因(> = 0.1.12),iranges(> = 1.13.36)
进口 方法,生物基因,,,,iranges
链接 iranges
建议 rsamtools(> = 1.7.42),BSGENOME,,,,rtracklayer,,,,GenomicFeatures,,,,Eatonetalchipseq(> = 0.0.3),Leebamviews,,,,EDGER,,,,deseq,,,,rtracklayer,,,,org.sc.sgd.db,,,,BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER2,,,,dexseq,,,,帕西拉,,,,pasillabamsubset,,,,变体,,,,运行
系统要求
增强
URL
取决于我 BSGENOME,,,,Cheung2010,,,,chipseq,,,,CN. -ops,,,,CSAR,,,,Deepsnv,,,,差异,,,,DSQTL,,,,EasyRnaseq,,,,Eatonetalchipseq,,,,外观复制,,,,fastseg,,,,GenomicFeatures,,,,Genoset,,,,ggtools,,,,ggtut,,,,Gwascat,,,,htseqtools,,,,Minfi,,,,图片,,,,repitools,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,片段,,,,seqbias,,,,Shortread,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20090506,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.2011119,,,,变体
进口我 arrayexpresshts,,,,Biovizbase,,,,chipseq,,,,chipseqr,,,,GenomicFeatures,,,,Genoset,,,,GGBIO,,,,GVIZ,,,,Leebamviews,,,,Lumi,,,,狭窄,,,,,,,,图片,,,,ping,,,,repitools,,,,RNASEQMAP,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,片段,,,,Shortread,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20090506,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.2011119
建议我 Beadarrayusecases,,,,生物基因,,,,狭窄,,,,repitools,,,,rnaseqtutorial
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Genomicranges_1.8.13.tar.gz
Windows二进制 Genomicranges_1.8.13.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/genomicranges/tree/release-2.10
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genomicranges/
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