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此软件包适用于生物导体的2.10版；对于稳定的最新版本，请参阅GenomicFeatures。

制作和操纵以转录为中心注释的工具

生物导体版本：2.10

一组以以转录为中心注释的工具和方法。使用这些工具，用户可以轻松地下载从UCSC基因组浏览器或BiomArt数据库中的成绩单，外显子和CD的基因组位置（将来会支持更多来源）。然后将该信息存储在本地数据库中，该数据库跟踪转录本，外显子，CD和基因之间的关系。提供了以方便格式提取所需功能的灵活方法。

作者：M。Carlson，H。Pages，P。Aboyoun，S。Falcon，M。Morgan，D。Sarkar，M。Lawrence

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

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文档

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Browsevignettes（“基因组曲折”）

PDF		制作和利用TranscriptDB对象
PDF		表示成绩单为剪接图
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，遗传学，，，，高通量序列，，，，基础设施，，，，软件
版本	1.8.3
在生物导体中	Bioc 2.5（R-2.10）（6。5年）
执照	艺术2.0
要看	生物基因（> = 0.1.0），iranges（> = 1.13.10），基因组机（> = 1.7.17），AnnotationDbi（> = 1.15.39）
进口	方法，DBI（> = 0.2-5），rsqlite（> = 0.8-1），生物基因，，，，iranges，，，，基因组机，，，，生物弦（> = 2.23.2），rtracklayer（> = 1.15.1），Biomart，，，，rcurl，utils，生物酶（> = 2.15.1）
链接
建议	rtracklayer，，，，Biomart，，，，org.mm.eg.db，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18（> = 1.3.14），bsgenome.celegans.ucsc.ce2，，，，mirbase.db，，，，fdb.ucsc.trnas，，，，运行，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown
系统要求
增强
URL
取决于我	fdb.ucsc.trnas，，，，ggtut，，，，txdb.Athaliana.biomart.plantsmart10，，，，txdb.Athaliana.biomart.plantsmart12，，，，txdb.celegans.ucsc.ce6.ensgene，，，，txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19.lincrnastranscripts，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.ensgene，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm9，，，，txdb.rnorvegicus.ucsc.rn4.ensgene，，，，txdb.scerevisiae.ucsc.saccer2.sgdgene
进口我	Biovizbase，，，，fdb.ucsc.trnas，，，，Genelendatabase，，，，GGBIO，，，，txdb.Athaliana.biomart.plantsmart10，，，，txdb.Athaliana.biomart.plantsmart12，，，，txdb.celegans.ucsc.ce6.ensgene，，，，txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19.lincrnastranscripts，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.ensgene，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm9，，，，txdb.rnorvegicus.ucsc.rn4.ensgene，，，，txdb.scerevisiae.ucsc.saccer2.sgdgene，，，，变体
建议我	生物弦，，，，chipseq，，，，EasyRnaseq，，，，基因组机，，，，ggtut，，，，Ind1kg，，，，rsamtools，，，，Shortread
构建报告

包装档案

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包源	genomicfeatures_1.8.3.tar.gz
Windows二进制	GenomicFeatures_1.8.3.zip
Mac OS X 10.6（雪豹）
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/genomicfeatures/tree/release-2.10
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomicfeatures/
软件包下载报告	下载统计