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生物导体版本:2.10
基因设置变异分析(GSVA)是一种非参数,无监督的方法,用于通过表达数据集的样本估计基因设定富集的变异。GSVA执行坐标系的变化,通过样品基质将来自基因的数据转换为样品基质的基因组,从而允许评估每个样品的途径富集。这种新的GSVA富集评分群体以途径为中心的方式促进应用功能性富集,存活分析,聚类,CNV途径分析或交叉组织途径分析等标准分析方法。
作者:justin guinney
维护者:Justin Guinney
引文(从R内,输入引文(“GSVA”)
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BROWSEVIGNETTES(“GSVA”)
PDF. | 基因集变异分析 | |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 生物信息学那微阵列那途径那软件 |
版本 | 1.4.4 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.8(R-2.13)(5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | R(> = 2.13.0),方法,GSEABASE.(> = 1.18.0) |
进口 | 方法,BioBase.那GSEABASE. |
链接到 | |
建议 | 林马那QPGraph..那RBGL.那图形那rghrachviz那rcolorbrewer.那Genefilter.那蒙链那edger.那gsvadata. |
系统要求 | |
加强 | 雪, 平行 |
URL. | http://www.sagebase.org. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | gsva_1.4.4.tar.gz. |
Windows二进制文件 | gsva_1.4.4.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/gsva/tree/release-2.10 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/gsva/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |