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GSVA.

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅GSVA.

基因集变异分析

生物导体版本:2.10

基因设置变异分析(GSVA)是一种非参数,无监督的方法,用于通过表达数据集的样本估计基因设定富集的变异。GSVA执行坐标系的变化,通过样品基质将来自基因的数据转换为样品基质的基因组,从而允许评估每个样品的途径富集。这种新的GSVA富集评分群体以途径为中心的方式促进应用功能性富集,存活分析,聚类,CNV途径分析或交叉组织途径分析等标准分析方法。

作者:justin guinney (罗伯特卡斯特尔罗和sonja haenzelmann的贡献

维护者:Justin Guinney

引文(从R内,输入引文(“GSVA”)):

安装

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文件

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BROWSEVIGNETTES(“GSVA”)

PDF. 基因集变异分析
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 生物信息学微阵列途径软件
版本 1.4.4
在生物导体中以来 BIOC 2.8(R-2.13)(5年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 R(> = 2.13.0),方法,GSEABASE.(> = 1.18.0)
进口 方法,BioBase.GSEABASE.
链接到
建议 林马QPGraph..RBGL.图形rghrachvizrcolorbrewer.Genefilter.蒙链edger.gsvadata.
系统要求
加强 , 平行
URL. http://www.sagebase.org.
取决于我
进口我
建议我
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 gsva_1.4.4.tar.gz.
Windows二进制文件 gsva_1.4.4.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/gsva/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/gsva/
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