要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOSemSim”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOSemSim.
Bioconductor版本:2.10
分别实现了Resnik、Schlicker、Jiang、Lin和Wang提出的5种GO语义相似度估计方法。支持许多物种,包括按蚊,拟南芥,牛,犬,鸡,黑猩猩,大肠杆菌菌株K12和酒井,苍蝇,人类,疟疾,老鼠,猪,恒河猴,大鼠,蠕虫,非洲爪蟾,酵母和斑马鱼。
作者:余光创
维护人员:guangchuangyu
引文(从R内,输入引用(“GOSemSim”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOSemSim”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GOSemSim”)
GOSemSim的介绍 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,聚类,去,通路,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.4 (R-2.9)(7年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.10) |
进口 | 方法,AnnotationDbi,GO.db,org.Hs.eg.db |
链接 | |
建议 | 剂量,clusterProfiler |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/26/7/976.full |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | clusterProfiler,剂量,ReactomePA |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GOSemSim_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOSemSim_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GOSemSim/tree/release-2.10 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSemSim/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |