要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOSemSim”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GOSemSim

此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOSemSim

语义相似性度量

Bioconductor版本:2.10

分别实现了Resnik、Schlicker、Jiang、Lin和Wang提出的5种GO语义相似度估计方法。支持许多物种,包括按蚊,拟南芥,牛,犬,鸡,黑猩猩,大肠杆菌菌株K12和酒井,苍蝇,人类,疟疾,老鼠,猪,恒河猴,大鼠,蠕虫,非洲爪蟾,酵母和斑马鱼。

作者:余光创

维护人员:guangchuangyu

引文(从R内,输入引用(“GOSemSim”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOSemSim”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GOSemSim”)

PDF GOSemSim的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学聚类通路软件
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.10)
进口 方法,AnnotationDbiGO.dborg.Hs.eg.db
链接
建议 剂量clusterProfiler
SystemRequirements
增强了
URL http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/26/7/976.full
全靠我
进口我
建议我 clusterProfiler剂量ReactomePA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GOSemSim_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 GOSemSim_1.14.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GOSemSim/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSemSim/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心