要安装此包,请启动R并输入:

##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)bioclite(“dexseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

Dexseq.

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Dexseq.

RNA-SEQ中差动外显子使用的推断

生物导体版本:2.10

该包装专注于使用具有不同实验设计的样品之间的RNA-SEQ外显子测定不同的外显子使用。它提供了允许用户基于使用负二项式分布的模型进行必要的统计测试的功能,以估计生物复制与用于测试的广义线性模型之间的差异。该包还提供了可视化和探索结果的功能。

作者:Simon Anders 和alejandro reyes ,都在Embl Heidelberg

维护者:Alejandro Reyes

引文(从R内,输入引文(“DEXSEQ”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)bioclite(“dexseq”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“DEXSEQ”)

PDF. 分析RNA-SEQ数据进行差动外显子使用与“DEXSEQ”包装
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 不同的亚兴Highthrougputsequencing.rnaseq.软件
版本 1.2.1
在生物导体中以来 BIOC 2.9(R-2.14)(4.5岁)
执照 GPL(> = 3)
依靠 BioBase.(> = 2.13.11)
进口 生物雕HWRITER., 方法,stringr.Statmod.(> = 1.4.15)
链接到
建议 帕西拉(> = 0.2.6)
系统要求
加强 多夜
URL.
取决于我 帕西拉
进口我
建议我 Genomicranges.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 dexseq_1.2.1.tar.gz.
Windows二进制文件 dexseq_1.2.1.zip.
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondion-mirror/dexseq/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/dexseq/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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