##尝试http：//如果不支持https：// urls源（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“Deseq”）

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅DESEQ.。

基于负二氯分布的差异基因表达分析

生物导体版本：2.10

估计来自高通量测序测定的计数数据中的差异意义依赖性以及使用负二项式分布的模型的差异表达式测试

作者：Simon Anders，Embl Heidelberg

维护者：Simon Anders

安装

要安装此包，请启动R并输入：

##尝试http：//如果不支持https：// urls源（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“Deseq”）

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“DESEQ”）

PDF.		使用“DESEQ”包分析RNA-SEQ数据
PDF.		vst.pdf.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	chipseq.那不同的亚兴那Highthrougputsequencing.那rnaseq.那智者那软件
版本	1.8.3
在生物导体中以来	BIOC 2.6（R-2.11）（6年）
执照	GPL（> = 3）
依靠	BioBase.（> = 2.13.11），Locfit.
进口	Genefilter.那Geneplotter.， 方法，大量的
链接到
建议	帕西拉（> = 0.2.11），VSN.
系统要求
加强
URL.	http://www-huber.embl.de/users/anders/deseq.
取决于我	easyrnaseq.那帕西拉
进口我	ArrayExpresshts.那困惑那edaseq.那rnaseqmap.
建议我	困惑那edaseq.那Genomicranges.那onechannelgui.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	deseq_1.8.3.tar.gz.
Windows二进制文件	deseq_1.8.3.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.6（雪豹）
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/deseq/tree/release-2.10
包短网址	http://biocumon.org/packages/deseq/
包裹下载报告	下载统计信息