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此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CancerMutationAnalysis．

癌症突变分析

Bioconductor版本:2.10

该软件包实现了癌症体细胞突变研究的基因和基因集水平分析方法。基因水平的方法区分驱动基因(在肿瘤发生中起积极作用)和乘客基因(在肿瘤样本中突变，但在肿瘤发生中没有作用)，并纳入两阶段研究设计。基因集方法实现了一种面向患者的方法，该方法为每个样本计算基因集得分，然后在整个样本中组合它们;还提供了使用Wilcoxon检验的基因导向方法进行比较。

作者:乔瓦尼·帕尔玛吉亚尼，西米娜·m·博卡

维护者:Simina M. Boca < Simina。博卡在nih.gov>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CancerMutationAnalysis”)

PDF		CancerMutationAnalysisTutorial
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	软件
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(4年)
许可证	GPL(>= 2) +文件许可
取决于	R (>= 2.10.0)，qvalue
进口	AnnotationDbi，limma、方法、统计
链接
建议	KEGG.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	CancerMutationAnalysis_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	CancerMutationAnalysis_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/CancerMutationAnalysis/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CancerMutationAnalysis/
软件包下载报告	下载数据