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这个包是2.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CSAR。

ChIP-seq数据的分析统计工具

Bioconductor版本:2.10

ChIP-seq数据分析的统计工具。包包括统计方法描述的考夫曼et al。(2009)《公共科学图书馆·生物学:7 (4):e1000090。短暂,平均DNA片段的大小进行排序,软件计算基因组单核苷酸read-enrichment值。正常化后,使用一个测试样本和控制比较基于泊松分布。检验统计量阈值来控制错误发现率是通过随机排列。

作者:Jose M Muino

维修工:Jose M Muino <何塞。在wur.nl muino >

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PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPseq,遗传学,软件,转录
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.15.0),IRanges,GenomicRanges
进口	统计,跑龙套
链接
建议	ShortRead,Biostrings
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	NarrowPeaks
建议我	NarrowPeaks
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	CSAR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	CSAR_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/csar/tree/release - 2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CSAR/
包下载报告	下载数据