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这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本，请参见BitSeq．

RNA-seq数据的转录表达推断和差异表达分析

Bioconductor版本:2.10

BitSeq包用于RNA-seq数据的转录表达分析和差异表达分析，分两阶段进行。在第一阶段，它使用贝叶斯推理方法从个体RNA-seq实验中推断个体转录本的表达。BitSeq的第二阶段是转录物表达的差异表达分析。从多个条件的重复中提供表达估计，估计的Log-Normal模型用于推断条件平均转录本表达，并根据差异表达的可能性对转录本进行排序。

作者:Peter Glaus, Antti Honkela和Magnus Rattray

维护人:Peter Glaus < Glaus at cs.man.ac.uk>

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BitSeq”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BitSeq”)

PDF		BitSeq用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，HighThroughputSequencing，RNAseq，软件
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 2.10 (R-2.15)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Rsamtools，zlibbioc
进口	IRanges
链接	Rsamtools，zlibbioc
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	BitSeq_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	BitSeq_1.0.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/BitSeq/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BitSeq/
包下载报告	下载数据