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在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

Biostrings

此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Biostrings

表示生物序列的字符串对象,以及匹配算法

生物导体版本:2.10

记忆有效的字符串容器,字符串匹配算法和其他实用程序,用于快速操作大型生物学序列或序列组。

作者:H. Pages, P. Aboyoun, R. Gentleman, S. DebRoy

维护者:H.页面

引文(从R内,输入引文(“Biostrings”)):

安装

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文件

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BROWSEVIGNETTES(“BIOSTRENERS”)

PDF. 在生物探测器2中定义的基本类的简短演示
PDF. 处理探测序列信息
PDF. 多次对齐
PDF. 成对序列对齐
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

biocViews DataImport.datarepresentation.遗传学基础设施序列术测序软件
版本 2.24.1.
在生物导体中以来 BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
执照 艺术-2.0
依靠 R(> = 2.8.0),方法,生物根系(> = 0.1.2),绞喉(> = 1.13.6)
进口 图形,方法,统计数据,Util,生物根系绞喉
链接到 绞喉
建议 bsgenome.(> = 1.13.14),bsgenome.celegans.ucsc.CE2.(> = 1.3.11),bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3.(> = 1.3.11),果蝇hgu95av2probe.hgu133aprobe.基因组法(> = 1.3.14),hgu95av2cdf.敬服yefydata.(> = 1.11.5),运行
系统要求
加强 RMPI.
URL.
取决于我 altcdfenvs.bsgenome.Chippeakanno.Chipsim解码Deepsnv.easyrnaseq.Generegionscan.哈巴普甲基onechannelgui.pd.ag.qrqcr453plus1toolbox.Redseq.RGADEM.RSAMTOOLS.SEQBIAS.缩短
进口我 倍数ArrayExpresshts.bcrank.bioseqclass.Biovizbase.魅力Chippeakanno.chipseqr.Chipsim解码Gcrma.Generegionscan.基因组法genosetGirafe.Gwascathit冰雹Medme.甲基microRNA.motifrg.oligo.oligoclasses.otubase.pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter.pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter.pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter.pd.aragene.1.0.st.pd.aragene.1.1.st.st.pd.ath1.121501.pd.barley1pd.bovgene.1.1.st.st.st.Pd.bovine.pd.bsubtilis.pd.cangeene.1.1.st.st.Pd.Canine.pd.canine.2pd.celegans.pd.charm.hg18.example.pd.chicken.Pd.Citrus.PD.COTTON.Pd.cygene.1.1.st.st.pd.cytogenetics.Array.pd.drosgenome1.pd.drosophila.2pd.e.coli.2.pd.ecoli.pd.ecoli.asv2.pd.equgene.1.0.st.st.pd.equgene.1.1.st.st.pd.feinberg.hg18.me.hx1.pd.feinberg.mm8.me.hx1.pd.felgene.1.1.st.st.st.pd.genomewidesnp.5.pd.genomewidesnp.6.pd.hc.g110pd.hg.focus.pd.hg.u133.plus.2pd.hg.u133a.pd.hg.u133a.2pd.hg.u133a.tag.pd.hg.u133b.pd.hg.u219.pd.hg.u95a.pd.hg.u95av2.pd.hg.u95b.pd.hg.u95c.pd.hg.u95d.pd.hg.u95e.pd.ht.hg.u133.plus.pm.pd.ht.hg.u133apd.ht.mg.430Apd.hu6800.pd.huex.1.0.st.v2.pd.hugene.1.0.st.v1pd.hugene.1.1.st.v1pd.maizepd.mapping250k.nsp.nsp.pd.mapping250k.sty.pd.mapping50k.hind240pd.mapping50k.xba240Pd.Medicago.pd.mg.u74a.pd.mg.u74av2.pd.mg.u74b.pd.mg.u74bv2.pd.mg.u74c.pd.mg.u74cv2.pd.mirna.1.0pd.moe430apd.moe430b.pd.moex.1.0.st.v1pd.mogene.1.0.st.v1pd.mogene.1.1.st.v1pd.mouse430.2pd.mouse430a.2pd.mu11ksubapd.mu11ksubbpd.ovigene.1.0.stpd.ovigene.1.1.st.st.st.pd.pae.g1a.pd.plasmodium.anopheles.pd.poplar.pd.portcine.pd.porgene.1.0.stPd.porgene.1.1.st.st.pd.rae230a.pd.rae230b.pd.raex.1.0.st.v1pd.ragene.1.0.st.v1pd.ragene.1.1.st.v1pd.rat230.2.pd.rg.u34apd.rg.u34bpd.rg.u34cpd.rhegene.1.1.st.st.PD.RESUSpd.rice.pd.rn.u34pd.s.aureus.pd.soybeanpd.soygene.1.1.st.st.pd.sugar.cane.pd.tomato.pd.u133.x3p.pd.vitis.vinifera.pd.wheatpd.x.laevis.2pd.x.tropicalis.pd.xenopus.laevis.pd.yest.2.pd.yg.s98pd.zebgene.1.1.stpd.czebrafish.pdinfobuilder.qrqcr453plus1toolbox.Redseq.RGADEM.RolexaRSAMTOOLS.rtracklayer.缩短VariantAnnotation
建议我 注释beadarrayusecases.CSAR.exoMecopy.基因组法microRNA.Minfi.PCAGOPRomoter.撤销SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815snplocs.hsapiens.dbsnp.20111119.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 BioStrings_2.24.1.tar.gz.
Windows二进制文件 BioStrings_2.24.1.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.6(雪豹)
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondudard-mirror/biostrings/tree/release-2.10
包短网址 http://biocidodder.org/packages/biostrings/
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