要安装此包,请启动R并输入:
##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)Bioclite(“Bionet”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonders 2.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅二乙衫。
生物导体版本:2.10
该包提供了蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的综合分析和功能模块的综合分析功能。可以通过将统计测试的P值分配给网络的节点来集成不同的数据集。例如。从亚胺阵列的基因的差异表达获得的p值被分配给网络的节点。通过拟合β均匀的混合物模型并从p值计算得分,可以计算网络区域的总分数,并且整数线性编程算法识别最大的评分子网络。
作者:Marcus Dittrich和Daniela Beisser
维护者:Marcus Dittrich
引文(从R内,输入引文(“双代购”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)Bioclite(“Bionet”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“Bionet”)
PDF. | 双硫教程 | |
PDF. | bum1.pdf. | |
PDF. | bum2.pdf. | |
PDF. | cytoscape.pdf. | |
PDF. | prec_recall_large.pdf.pdf. | |
PDF. | prec_recall_small.pdf.pdf. | |
PDF. | tutorial-3dplot.pdf. | |
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | 生物信息学那DataImport.那不同的亚兴那基因表达那graphsandnetworks.那微阵列那软件那可视化 |
版本 | 1.14.3. |
在生物导体中以来 | BIOC 2.7(R-2.12)(5.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | r(> = 2.10.0),BioBase.那图形那RBGL. |
进口 | iGraph0,annotationdbi. |
链接到 | |
建议 | rgl.那赋予那DLBCL.那Genefilter.那xtable.那全部那林马那hgu95av2.db.那XML. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http:///bionet.bioApps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/ |
取决于我 | Htsanalyzer. |
进口我 | Htsanalyzer. |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | Bionet_1.14.3.tar.gz. |
Windows二进制文件 | Bionet_1.14.3.zip. |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/bionet/tree/release-2.10 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/bioneT/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |