要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ADaCGH2”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ADaCGH2.
Bioconductor版本:2.10
阵列CGH数据的分析与绘制。允许使用圆形二进制分割,基于小波的平滑(包括Liu等人,以及Ben-Yaacov和Eldar中的HaarSeg), HMM, BioHMM, GLAD, CGHseg。大多数计算是并行的。
作者:Ramon Diaz-Uriarte
维护者:Ramon Diaz-Uriarte
引文(从R内,输入引用(“ADaCGH2”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ADaCGH2”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ADaCGH2”)
ADaCGH2概述 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariants,微阵列,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 2.11.0),tilingArray,aCGH,waveslim,集群,snapCGH,降雪,ff |
进口 | |
链接 | |
建议 | 很高兴,DNAcopy,CGHregions,rlecuyer |
SystemRequirements | |
增强了 | Rmpi,多核 |
URL | http://launchpad.net/adacghhttp://wavicgh.bioinfo.cnio.es |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ADaCGH2_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | ADaCGH2_1.6.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ADaCGH2/tree/release-2.10 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ADaCGH2/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |