要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ADaCGH2”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

ADaCGH2

此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ADaCGH2

利用并行计算和ff对象分析aCGH实验数据

Bioconductor版本:2.10

阵列CGH数据的分析与绘制。允许使用圆形二进制分割,基于小波的平滑(包括Liu等人,以及Ben-Yaacov和Eldar中的HaarSeg), HMM, BioHMM, GLAD, CGHseg。大多数计算是并行的。

作者:Ramon Diaz-Uriarte , Oscar M. Rueda < Rueda。Om在gmail.com>。基于小波的aCGH平滑代码从李Hsu 和道格拉斯格罗夫。Imagemap代码从Barry Rowlingson 。HaarSeg代码来自Erez Ben-Yaacov;下载自

维护者:Ramon Diaz-Uriarte

引文(从R内,输入引用(“ADaCGH2”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ADaCGH2”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ADaCGH2”)

PDF ADaCGH2概述
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariants微阵列软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 2.11.0),tilingArrayaCGHwaveslim集群snapCGH降雪ff
进口
链接
建议 很高兴DNAcopyCGHregionsrlecuyer
SystemRequirements
增强了 Rmpi,多核
URL http://launchpad.net/adacghhttp://wavicgh.bioinfo.cnio.es
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 ADaCGH2_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 ADaCGH2_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ADaCGH2/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ADaCGH2/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心