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ACME

此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ACME

计算微阵列富集(ACME)算法

Bioconductor版本:2.10

ACME(算法计算微阵列富集)是一套工具,用于分析平片阵列ChIP/ ChIP, DNAse超敏反应,或其他导致基因组区域显示“富集”的实验。它不依赖于特定的阵列技术(尽管阵列应该是一个“平铺”阵列),非常通用(可以应用于导致富集区域的实验),并且对阵列噪声或归一化方法非常不敏感。它的运算速度非常快,在有足够内存的情况下,可以很容易地应用于全基因组平铺阵列实验。

作者:Sean Davis

维护者:Sean Davis

引文(从R内,输入引用(“极致”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ACME”)

文档

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browseVignettes(“极致”)

PDF ACME
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学软件
版本 2.12.0
在Bioconductor BioC 2.0 (R-2.5)(9年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.10),Biobase(>= 2.5.5),方法
进口 图形、统计数据
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://watson.nci.nih.gov/~sdavis
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 ACME_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 ACME_2.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ACME/tree/release-2.10
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ACME/
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