VSN.
微阵列数据的方差稳定和校准
该包装实现了参考文献中描述的微阵列数据的随机模型的最大似然估计器的鲁棒型。该模型包括数据校准(AKA归一化),是依赖于平均强度的差异的模型,以及稳定数据变换的方差。转换强度之间的差异类似于“归一化对数比率”。然而,与后者相比,它们的差异与平均值无关,并且它们通常更敏感,并且在检测差分转录方面是更敏感的。
作者 |
Wolfgang Huber,A.Von Heydebereck的贡献 |
维护者 |
Wolfgang Huber. |
要安装此包,请启动R并输入:
源(“http://biocondudder.org/bioclite.r”)Bioclite(“VSN”)
细节
Biocviews. |
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依靠 |
R,方法,生物酶,贴阳,雷玛 |
建议 |
Affydata,Hgu95av2CDF,Geneplotter |
进口 |
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系统要求 |
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执照 |
艺术许可证2.0 |
URL. |
http://www.r-project.org,http://www.ebi.ac.uk/huber. |
dependsonme. |
ringo,arraymagic,srassqualitymetrics,cellhts2,tilingarray,webbioc |
建议 |
Globalancova,Adsplit,Beadarray,CellHts,Ecolitk,Globaltest,Limma,Lumi,Twilight |