simpleaffy

非常简单的Affymetrix数据高级分析

提供高级函数来读取Affy . cel文件,表型数据,然后用它计算简单的事情,如t检验,折叠变化等。充分利用affy库。也有一些基本的散点图功能和机制,以产生高分辨率期刊数字…

作者 Crispin J•米勒
维护人员 Crispin米勒

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“simpleaffy”)

小插曲(文档)

包下载

QCandSimpleaffy.pdf
simpleAffy.pdf
simpleaffy_2.14.05.tar.gz
Windows二进制 simpleaffy_2.14.05.zip
OS X的二进制 simpleaffy_2.14.05.tgz

细节

biocViews
取决于 R, affy,基因过滤,Biobase,方法,utils, gcrma
建议
进口 方法,跑龙套
SystemRequirements
许可证 GPL版本2或更高版本
URL //www.anjoumacpherson.com, http://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
dependsOnMe affyQCReport、arrayQualityMetrics exonmap
suggestsMe AffyExpress