光民

BeadArray Illumina公司芯片的具体方法

光民包提供了一个集成解决方案的Illumina公司微阵列数据分析。它包括Illumina公司BeadStudio数据输入功能,质量控制,BeadArray-specific方差稳定,标准化和基因注释在调查水平。

作者 林杜潘,沃伦·基布,西蒙
维护人员 杜潘

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“光民”)

小插曲(文档)

包下载

Bioc2007_lumi_presentation.pdf
lumi.pdf
lumi_VST_evaluation.pdf
lumi_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 lumi_1.4.0.zip
OS X的二进制 lumi_1.4.0.tgz

细节

biocViews
取决于 affy, R, Biobase mgcv、注释的方法
建议 beadarray、limma vsn、lumiBarnes lumiHumanV1, genefilter, geneplotter RColorBrewer
进口
SystemRequirements
许可证 LGPL版本2或更新
URL
dependsOnMe
suggestsMe beadarray