limma

微阵列数据的线性模型

微阵列数据的数据分析、线性模型和差异表达。

作者 Gordon smith与Matthew Ritchie, Jeremy Silver, James Wettenhall, Natalie Thorne, Mette Langaas, Egil Ferkingstad, Marcus Davy, Francois Pepin和Dongseok Choi的贡献。
维护人员 戈登•史密斯

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“limma”)

小插曲(文档)

包下载
limma.pdf
usersguide.pdf
源 limma_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 limma_2.12.0.zip
OS X的二进制 limma_2.12.0.tgz

细节

biocViews
微阵列,OneChannel,TwoChannel,DataImport,质量控制,预处理,统计数据,DifferentialExpression,MultipleComparisons,TimeCourse
取决于 R,方法
建议 affy, marray, MASS，样条函数，sma, statmod, vsn
进口
SystemRequirements
许可证 LGPL
URL http://bioinf.wehi.edu.au/limma
dependsOnMe AffyExpress, CALIB, RMAGEML, Ringo, affycoretools, affylmGUI, arrayMagic, arrayQuality, beadarray, codelink, convert, explorase, limmaGUI, maDB, maigesPack, marray, puma, snapCGH, timecourse, vsn
suggestsMe ABarray, GEOquery, OLIN, beadarraySNP, lumi, maSigPro