fbat

基于家庭协会测试基因数据。

这个方案实现了一个基于广泛的家庭类genetids协会测试数据,调整人口外加剂使用“FBAT”软件程序的代码(见http://www.biostat.harvard.edu/ ~ FBAT / fbat.htm)。功能包括:使用数据从核心家庭,兄弟姊妹,起源,或任意组合;提供公正的测试有或没有创始人基因型。——分析二分、测量或time-to-onset特征和多个特征;特征定义可以优化。-提供bi-allelic结社和multi-allelic测试用标准遗传模型(添加剂、显性、隐性或基因型)。——提供了大样本和蒙特卡罗的零假设的测试:没有联系,没有联系;提供了大样本测试H0:没有联系。——估计等位基因频率;检查孟德尔一致性。 - Tests multiple markers using haplotypes; estimates haplotype frequencies and linkage disequilibrium between pairs of markers. - Offers two multi-marker tests for testing multiple markers simultaneously, without resolving phase or assuming no recombination. - Uses standard pedigree data files; phenotype file is optional. - Offers the Sibs Disequilibrium Test.

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“fbat”)

细节